La Comisión Europea es la institución que representa y protege, con total independencia, los intereses generales de la Unión. Cada cinco años, dentro de un plazo de seis meses desde las elecciones al Parlamento Europeo, se designa una nueva Comisión. Esta está formada por 27 comisarios (uno por cada Estado de la UE) bajo la dirección de un presidente, el cual decide las diferentes competencias políticas.

Cada año la Comisión publica su propio programa de trabajo junto con todos los documentos estratégicos en los que se ilustran las actividades futuras y las ya realizadas.

Dicho programa establece un plan de acción para los 12 meses inmediatamente posteriores e indica cómo la Comisión pretende poner en práctica las prioridades políticas establecidas por su presidente. El programa se sitúa en una perspectiva plurianual para permitir a las partes interesadas, y a las otras instituciones de la UE, planificar su colaboración con la Comisión.

La Comisión cumple cuatro funciones principales:

• propone los actos legislativos al Parlamento y al Consejo de la Unión;
• dirige y aplica las políticas comunes de la Unión y asigna los fondos europeos;
• ejerce un control general sobre la correcta aplicación del derecho de la UE, sin perjuicio de las prerrogativas del Tribunal de Justicia;
• representa a la Unión Europea a nivel internacional, por ejemplo, en las negociaciones con terceros países para la celebración de acuerdos, sin perjuicio de las prerrogativas del Presidente del Consejo Europeo.

La sede de la Comisión se encuentra en Bruselas, pero también cuenta con oficinas en Luxemburgo y representaciones en todos los países de la UE, así como delegaciones en numerosas capitales del mundo. En Italia, sus oficinas se encuentran en Roma y Milán.

Desde el 1 de diciembre de 2019, Ursula von der Leyen (Alemania) se encarga de la función de presidenta de la Comisión Europea.

Se ha atribuido a Paolo Gentiloni, antiguo Primer Ministro italiano, el papel de Comisario de Economía.